Barbieri foi mantido no comando técnico para a disputa do campeonato estadual. A estréia foi no dia 12 de janeiro, diante da equipe do Roma, no Estádio do Pinheirão. Rafael Mussamba fez o gol da vitória. No dia 19 de fevereiro o Paraná Clube ganhou o clássico contra o Coritiba por 3x1, quebrando um jejum de vitórias em cima do rival que durava 5 anos. Com um empate em Irati e uma vitória por 1x0 no jogo de volta, no Pinheirão, o Paraná consegue a classificação.
Nas semi-finais o tricolor enfrentou a equipe do Rio Branco de Paranaguá. A primeira partida aconteceu no Estádio da Estradinha em Paranaguá, e com dois gols de Maicossuel, o Paraná Clube ganhava o primeiro jogo. O segundo confronto foi realizado no Estádio do Pinheirão, e com uma vitória por 3x0, o Paraná Clube conquistava a vaga para a finalíssima.
Na decisão o embate seria diante da equipe da ADAP de Campo Mourão. A primeira partida foi disputada no Estádio Willi Dawis em Maringá, e com uma vitória por 3x0, o Paraná já colocava a mão na taça. No dia 9 de maio, 25.306 torcedores tricolores foram ao Estádio Pinheirão, para ver o Paraná empatar em 1x1 o segundo jogo e comemorar o 7° título paranaense.
O Paraná Clube participa pela segunda vez da Copa Sul-americana.
Sob o comando do técnico Ari Marques, e com um time formado por jogadores da categoria de júnior, o tricolor participa da Copa 100 anos, promovido pela FPF.
Para o brasileirão, a diretoria trouxe novamente Caio Júnior, e manteve alguns jogadores que foram campeões paranaenses. A primeira vitória em casa aconteceu na terceira rodada, contra o Grêmio, por 5x2. Com esse placar, a equipe mantinha uma invencibilidade de 13 jogos no Estádio do Pinheirão – sete vitórias e seis empates.
20 de agosto. O Paraná Clube vencia a equipe do São Caetano por 1x0, e assumia a 2ª colocação do campeonato brasileiro. Com mais uma vitória, por 3x1 diante da equipe do Fluminense, o time jogava a sua última partida no Pinheirão. No dia 20 de setembro o Paraná Clube voltava a mandar os seus jogos oficiais no Estádio Durival Britto e Silva, e o atacante Leonardo foi o autor do primeiro gol da nova Vila Capanema, na vitória por 2x0 diante da equipe do Fortaleza.
Com um empate em 0x0 diante do São Paulo o Paraná conquista a até então inédita vaga para a Taça Libertadores da América, em 2007.
Em sua décima quarta participação no Campeonato Brasileiro da 1ª divisão o Paraná Clube ficou em 5° lugar, alcançando a marca de 18 vitórias e 6 empates.